پروتگانشناسی مقایسهایcomparative proteomics, differential proteomicsواژههای مصوب فرهنگستانشاخهای از پروتگانشناسی که به مقایسۀ پپتیدها و پروتئینهای دو سامانۀ زیستی میپردازد
پروتگانشناسی شیمیاییchemical proteomicsواژههای مصوب فرهنگستانشاخهای از پروتگانشناسی که در آن برهمکنشهای ترکیبات کوچک با پپتیدها یا پروتئینهای هدف مطالعه میشود
پروتگانشناسی کارکردیfunctional proteomicsواژههای مصوب فرهنگستانمجموعه فنونی برای تحلیل کارکردی همۀ پپتیدها و پروتئینهای یاخته در زمانی معین
قندپروتگانشناسیglycoproteomicsواژههای مصوب فرهنگستانمجموعۀ فنون مربوط به مطالعۀ برهمکنش قندها و پروتئینهای یک سامانۀ زیستی در زمان و شرایط مشخص متـ . قندگانشناسی glycomics
لیپوپروتگانشناسیlipoproteomicsواژههای مصوب فرهنگستانمجموعۀ فنون مربوط به شناسایی و تشخیص حبههای پروتئین و برهمکنش آنها با لیپیدها و جهشهایی که در بیانۀ ژنهای نهفته رخ میدهد