پروتگانشناسی شیمیاییchemical proteomicsواژههای مصوب فرهنگستانشاخهای از پروتگانشناسی که در آن برهمکنشهای ترکیبات کوچک با پپتیدها یا پروتئینهای هدف مطالعه میشود
پروتگانشناسی کارکردیfunctional proteomicsواژههای مصوب فرهنگستانمجموعه فنونی برای تحلیل کارکردی همۀ پپتیدها و پروتئینهای یاخته در زمانی معین
پروتگانشناسی مقایسهایcomparative proteomics, differential proteomicsواژههای مصوب فرهنگستانشاخهای از پروتگانشناسی که به مقایسۀ پپتیدها و پروتئینهای دو سامانۀ زیستی میپردازد
ایمنیگانشناسیimmunomicsواژههای مصوب فرهنگستانمجموعۀ فنون مربوط به تفکیک و خالصسازی و شناسایی و تشخیص همۀ پپتیدها و پروتئینهای سامانۀ ایمنی و ژنهای آن متـ . ایمنیپروتگانشناسی immunoproteomics